所谓药物的作用靶点，是说药物进入人体后是通过与人体效应器的某一部位结合而发挥作用，那么这一部位称为药物的作用靶点，其实就是药物在体内发挥作用的结合位点，包括基因位点、受体、酶、离子通道等。多靶点，就是药物可以与机体内多个部位相结合而保证药物疗效的发挥。
连花清瘟药物作用体现多靶点
连花清瘟是运用中医络病理论探讨外感温病及瘟疫传变的规律及治疗，提出“积极干预”治疗对策：卫气同治，表里双解；先证用药，截断病势；整体调节，多靶治疗。该药汇聚了历代医家治疗外感温病及疫证的用药精华，以《伤寒论》麻杏石甘汤合《温病条辨》银翘散化裁，汲取明代吴又可《温疫论》治疫证用大黄经验，配伍红景天清肺化瘀，调节免疫，同时结合现代科学研究发现的抗病毒、抗炎、止咳、化痰、增强免疫的有效中药研制而成。
它的药物组成涵盖了辛凉透表、宣肺泄热、止咳平喘、清热解毒等药物，现代药理研究发现，这些药物组合具有良好的退热、止咳、抗炎、抗病毒作用。也就是说它发挥作用不像西药是单一功能，而是具备多重药效。
连花清瘟处方中除应用麻杏石甘汤与银翘散外，还有三大用药特点。第一，组方中采用大黄通腑泄肺，肺与大肠相表里，让“疫毒”从大便排出，使邪有出路；使用大黄另一价值是先证用药，截断病势。明代吴又可曾指出，瘟疫治疗宜在人体正气未衰之时，及早攻逐邪气，提前应用通便的大黄，可以截断病情向危重传变。现代药效研究证实大黄具有抑制肺部炎症，改善肺功能作用。第二，运用藿香芳香化湿、避秽化浊，改善食欲不振、湿困脾胃的状况。第三，连花清瘟中还有关键的一味药是红景天，它生长在高寒、高海拔地区，可以提高人体抗疲劳、耐缺氧能力，同时红景天的增强免疫作用可以改善患者机体抗病能力下降，提高机体的抗病康复能力。
治疗普通感冒体现多靶点
普通感冒90%以上是病毒传播引起，以鼻病毒为多。临床表现多为喷嚏、流涕、发热或不发热、咽痛、咳嗽，连花清瘟辛凉解表、发散风热作用，可以迅速改善打喷嚏、流鼻涕；清热解毒、宣泄肺热作用，可以消除发热、咽喉疼痛、咳嗽咳痰等症状；提高机体免疫机能的特性，可以防止感冒病程迁延。早用药，身体早轻松。而发挥这些作用的根本是连花清瘟具有的多靶点效应，既抗普通感冒病毒、抗炎、抑菌，还能止咳化痰，所以我们在感冒服用连花清瘟后都有这样的体会，伴随着咽喉部清凉的感觉，发热、咽痛、咳嗽都解决了，这就是中药与西药的不同之处。
治疗流感发挥多靶点作用
我们知道，流感比普通感冒表现的要剧烈得多，有的人一上来就是发热或高热、周身酸痛、头痛、咽痛、咳嗽、痰粘不易咳出。连花清瘟卫气同治、表里双解的特性，既能通过清热解毒、宣泄肺热让体温回归正常，又能改善头痛、肌肉酸痛、咳嗽咳痰等症状。尤其是药中的大黄让体内热毒随大便排泄的特性，成就了连花清瘟使体温下降后不容易再上升，这也是与西药退烧药最大的区别。我们都有这样的体会，用西药退烧药可以降下体温，但过几个小时，体温还会上升，这是因为西药退烧药不能改善人体的内环境，也就是毒邪还在体内，中药可以改变人体的内在环境，多种药物作用融为一体，一个药物改善多种症状。
中国中医科学院等科研院所基础研究证实，连花清瘟具有整体调节、多靶点发挥作用的优势：明显抑制SARS、甲型流感H1N1、H3N2、禽流感H5N1、H9N2、H7N9等多种病毒；有效抑制多种细菌，有利于治疗混合感染；退热抗炎，止咳化痰；调节免疫，增强抗病康复能力，减少流感及肺部感染的反复发作，显示出多靶点、整体调节的特色优势。
连花清瘟对多种病毒感染性疾病的治疗，发挥作用的根本是通过整体调节和多靶点治疗。它针对的是发热、咳嗽、痰黏不能咳出、咽痛、乏力、肌肉酸痛等这样一个外感热病的症候群，作用机理在于针对多个靶点，协同发挥抗炎、抗病毒、止咳平喘、增强机体免疫作用。只要症候群相同，不论是新冠肺炎，还是普通感冒、流感，都可以使用连花清瘟进行治疗。
